Não é necessário cocô: os pesquisadores planejam exames de sangue para a diversidade do microbioma intestinal usando dados da startup extinta Arivale

Se você quer saber o que está acontecendo no seu microbioma intestinal, a comunidade de bactérias em nossos intestinos que estão ligadas à saúde em geral, existem muitas empresas dispostas a ajudar. Você só precisa pagá-los - e enviar uma amostra de cocô.

Mas acontece que engarrafar fezes não é a única maneira de obter informações sobre o intestino. Pesquisadores do Instituto de Biologia de Sistemas (ISB), em Seattle, criaram uma nova maneira de analisar o estado do seu microbioma com um exame de sangue.

As startups de microbiomas proliferaram nos últimos anos. Alguns estão buscando a descoberta de medicamentos para doenças específicas, como Finch Therapeutics e Maat Pharma. Outros, incluindo o Viome, de Seattle, estão vendendo insights sobre microbiomas diretamente aos consumidores para a saúde em geral.

Dado o estágio relativamente inicial da pesquisa sobre microbiomas, os críticos questionaram como os insights úteis dosintestino pode ser.É por isso que os pesquisadores da ISB decidiram se concentrar na diversidade de micróbios.

“Não existe uma boa correlação entre a diversidade em si e a saúde clínica. Mas há casos específicos em que parece ser um enorme fator de risco ”, disse o Dr. Sean Gibbons, que trabalhou com o Dr. Nathan Price no estudo, publicado hoje na Nature Biotechnology.

A baixa diversidade de microbiomas é um forte fator de risco para pacientes com Clostridium difficile (C. diff) recorrente, disse Gibbons.C. diff é uma bactéria potencialmente fatal que volta em quase um terço dos pacientes após o tratamento com antibióticos.

"Obter essas infecções recorrentes é muito difícil para os pacientes"Gibbons disse.“Se você pudesse evitar esse ciclo, não apenas poderia diminuir o custo dos cuidados de saúde, como também estaria salvando vidas e produzindo muito menos sofrimento.”

Pacientes com C.O diff pode ser tratado com um transplante fecal, mas esses somente são administrados após a falha dos antibióticos. Gibbons acha que um exame de sangue pode pré-selecionar pacientes com risco de recorrência de C. diff e evitar o ciclo doloroso.

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Para criar o teste, os pesquisadores se apoiaram fortemente nos dados compilados pela Arivale, uma startup de Seattle que tinha como objetivo ajudar as pessoas a se tornarem mais saudáveis ​​e evitar doenças através do bem-estar.

A Arivale foi encerrada em abril depoisnão conseguiu encontrar um mercado para o seu serviço caro. Mas o Dr. Lee Hood, co-fundador da Arivale e da ISB, resgatou grande parte dos dados e da tecnologia desde a inicialização e os trouxe para a ISB.

Esse recurso forneceu à Price and Gibbons dados extensos sobre centenas de antigosClientes da Arivale que tiveram seus microbiomas sequenciados e seu sangue testado, entre outros testes. Os pesquisadores foram capazes de treinar um modelo para prever quais indivíduos têm uma diversidade de microbiomas muito baixa, analisando 11 metabólitos sanguíneos. Os clientes da Arivale deram permissão para que seus dados fossem usados ​​para pesquisa e as informações foram anonimizadas.

O estudo da ISB é um "belo exemplo" de como as nuvens de dados pessoais podem dar novas informações. insights sobre biologia e doenças, Hood disse ao GeekWire em um e-mail.

Eles também descobriram o que eles acreditam ser uma "zona de ouro" da diversidade intestinal. Pessoas com baixa diversidade tendiam a ter diarréia e inflamação, enquanto aquelas com uma diversidade muito alta tendiam a constipar-se ou a ter toxinas no sangue.

Com a ajuda dos dados de Arivale, os pesquisadores da ISB pensam em idéias mais relacionadas ao microbiomapode ser encontrado."Estamos tentando construir um mapa real que pode levar a insights úteis sobre como manipular o microbioma", disse Gibbons.

Uma desvantagem do conjunto de dados é que ele se inclina para pessoas brancas preocupadas com a saúde, que eram mais propensos a ser os clientes da Arivale."É uma amostra um pouco tendenciosa", disse Gibbons.

No futuro, o ISB pretende fazer parceria com a Providence St. Joseph Health, que daria aos pesquisadores acesso a uma população mais representativa.>

Via: Geek Wire